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SNOMED CT 應用

SNOMED CT(醫學術語系統命名法-臨床術語)標準醫學詞彙的導入可在醫療期間使用一致、通用的表示方式記錄相關臨床資訊。透過數據收集,針對患者提供護理照護的其他人共享適當的資訊,使所有提供者能夠以通用的方式理解和解釋醫療資訊。電子健康記錄 (EHR) 的使用可以改善溝通並提高醫療資訊的可用性,如果臨床資訊的儲存允許基於意義的檢索,則可有效提升臨床效益。包括增加即時決策支援以及更準確的研究和管理回顧性報告。

範例:
SNOMED CT的分層性質允許以不同的詳細程度記錄訊息,以適應特定用途。
例如 : |肺炎(pneumonia)|、|細菌性肺炎(bacterial pneumonia)| 或 |肺炎球菌肺炎(pneumococcal pneumonia)|

SNOMED CT允許透過組合來添加額外的細節 :
例如 : |肺炎球菌肺炎| 的 |finding site| 為 |右肺上葉(right upper lobe of lung) |

SNOMED CT 層次結構的性質允許選擇性檢索和重複使用資訊,以滿足不同概括級別的不同要求。
例如 : 檢索 |肺部疾病| 或 |細菌感染(bacterial infection)| 的亞型都包括 |細菌性肺炎|

SNOMED CT 概念模型還允許在檢索資料時考慮其他細節 :
例如 : 概念 |肺炎球菌| 是 |細菌性肺炎| 的一個亞型,它具有定義關係,指定 |病原體| 是 |肺炎鏈球菌| 這使得能夠對引起這種疾病的生物體進行分析。
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SNOMED CT 表達式

SNOMED CT 表達式是一個或多個概念標識符的結構化組合,用於以邏輯方式表示臨床想法。
使用 SNOMED CT 概念的臨床表達可以有兩種類型:
1. 預先(precoordinated)協調表達,使用單一 SNOMED CT 概念標識符;
2. 後協調(postcoordinated)表達式,其中包含多個 SNOMED CT 標識符。

後協調技術的支援允許在需要時顯示額外的臨床細節。
Ex. |肺炎球菌肺炎| 有一個 |finding site| |肺結構| -> | 右上肺葉|
後協調組合方式增加了 SN​​OMED CT 可以表示的細節深度,而不必透過概念包含每種可能疾病的每個可能的特定位點。

範例:
Precoordinated representation of "Laparoscopic emergency appendectomy"
(腹腔鏡急診闌尾切除術)
Identifier of this concept : 174041007

「腹腔鏡緊急闌尾切除術」手術至少有三個不同的面向:「切除闌尾」、「使用腹腔鏡」 「緊急程序」。
SNOMED CT 概念 174041007 |腹腔鏡急診闌尾切除術|預先協調這些方面,因為其定義包括以下定義關係:
116680003 |is a| = 80146002 |闌尾切除術|
260870009 |priority| = 25876001 |緊急|
425391005 |using access device| = 86174004 |腹腔鏡|
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以 SNOMED CT 瀏覽器搜尋概念碼

Precoordinated representation of "Laparoscopic emergency appendectomy"
(腹腔鏡急診闌尾切除術)
Identifier of this concept : 174041007

將概念碼填入SCT Browser進行搜尋:
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以 SNOMED CT 瀏覽器搜尋詞彙 : 以心室中膈缺損為例

概念30288003(心室中膈缺損)作為前協調表達,亦可由253549006(室隔間異常)及253273004(心臟間隔缺損)兩個概念的組合。以關聯性表示,本範例概念(30288003)由兩種關聯屬性建立關係,其一為組成型態之屬性,其關聯到型態異常之概念(783804002),另一個則為發現部位之屬性,其關聯到室間隔結構之概念(589001)。
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SNOMED CT 檔案說明 : 描述及關聯表

SNOMED CT 不是軟體,其檔案被設計為關係表。文件中的每一行代表表中的一行,每個表格的第一行包含列標題, 所有其他行都包含資料。SNOMED CT 國際版以 UTF-8 編碼的製表符分隔平面檔案形式提供,可匯入任何資料庫或其他軟體應用程式。SNOMED CT國際版之檔案每個月更新一次,檔案命名以Description為例: sct2_Description_Full-en_INT_日期版本.txt。

SCT Files

sct2_Description_Full-en_INT_日期版本.txt之檔案內容格式如下表說明:

sct2 Description

摘錄Description部分檔案資料作為範例說明:

sct2 Description example

sct2_Relationship_Full-en_INT_日期版本.txt之檔案內容格式如下表說明:

sct2 Relationship

摘錄Relationship部分檔案資料作為範例說明:

sct2 Description example

SNOMED CT 關聯表之視覺化應用

SCT所提供的關聯表可以透過工具建立視覺畫圖示,用來表示疾病部位、疾病型態等之關聯,如附圖之範例。

SCT visual example

參考工具:
Cytoscape是一款網路分析的工具,以視覺化和社會網路(social network)進行分析,支持各種文件格式、數據庫的連接以及在社會網路中進行搜索。Cytoscape作為一款視覺化和社會網路分析的工具,不需要任何程式語言基礎即可操作,其能夠將不同屬性的資料合成視覺化社會網路,對於日後資料分析而言,大數據實現資料視覺化將是一大趨勢。在3.0版本之後,Cytoscape的核心開發團隊,並行了Cytoscape.js的專案,且具有Restful API,讓Cytoscape視覺化的模塊可以有更多的影響力,而不侷限在生醫領域。

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