Logo - 臺灣醫療資訊標準大平台

臺灣醫療資訊標準大平台

最新消息
簡介與沿革
部長的話
處長的話
背景說明
原電子病歷專區
FHIR
什麼是 FHIR
FHIR 教育專區
國家實作指引 (IG) 專區
實作指引 (IG) 提案暨審查作業及說明
實作指引 (IG) 草稿及提案
民間實作指引 (IG) 分享專區
TWCDI
TWCDI +
TWCDI 提案
Tool
全國專門術語平台
Rule Library
什麼是 Rule Library
CQL 教育專區
應用情境說明
CQL 測試環境
Library 資源
SMART on FHIR
什麼是 SMART
SMART 教育專區
APP 開發說明
上架流程範例
TW APP Gallery
SNOMED CT
什麼是 SNOMED CT
SCT 教育專區
SCT 官方文件與工具
SCT 資料集
LOINC
什麼是 LOINC
LOINC 教育專區
LOINC 官方文件與工具
LOINC 資料集
RxNorm
什麼是 RxNorm
RxNorm 教育專區
RxNorm 官方文件與工具
線上提問專區
最新消息
簡介與沿革部長的話處長的話背景說明原電子病歷專區
FHIR
什麼是 FHIRFHIR 教育專區
國家實作指引 (IG) 專區實作指引 (IG) 提案暨審查作業及說明實作指引 (IG) 草稿及提案民間實作指引 (IG) 分享專區
TWCDITWCDI +TWCDI 提案
Tool全國專門術語平台
Rule Library
什麼是 Rule LibraryCQL 教育專區應用情境說明CQL 測試環境Library 資源
SMART on FHIR
什麼是 SMARTSMART 教育專區APP 開發說明上架流程範例TW APP Gallery
SNOMED CT
什麼是 SNOMED CTSCT 教育專區SCT 官方文件與工具SCT 資料集
LOINC
什麼是 LOINCLOINC 教育專區LOINC 官方文件與工具LOINC 資料集
RxNorm
什麼是 RxNormRxNorm 教育專區RxNorm 官方文件與工具
線上提問專區

SCT 教育專區

首頁
什麼是 SNOMED CT

SCT 教育專區

SNOMED CT 應用

SNOMED CT(醫學術語系統命名法-臨床術語)標準醫學詞彙的導入可在醫療期間使用一致、通用的表示方式記錄相關臨床資訊。透過數據收集,針對患者提供護理照護的其他人共享適當的資訊,使所有提供者能夠以通用的方式理解和解釋醫療資訊。電子健康記錄 (EHR) 的使用可以改善溝通並提高醫療資訊的可用性,如果臨床資訊的儲存允許基於意義的檢索,則可有效提升臨床效益。包括增加即時決策支援以及更準確的研究和管理回顧性報告。

範例:
SNOMED CT的分層性質允許以不同的詳細程度記錄訊息,以適應特定用途。
例如 : |肺炎(pneumonia)|、|細菌性肺炎(bacterial pneumonia)| 或 |肺炎球菌肺炎(pneumococcal pneumonia)|

SNOMED CT允許透過組合來添加額外的細節 :
例如 : |肺炎球菌肺炎| 的 |finding site| 為 |右肺上葉(right upper lobe of lung) |

SNOMED CT 層次結構的性質允許選擇性檢索和重複使用資訊,以滿足不同概括級別的不同要求。
例如 : 檢索 |肺部疾病| 或 |細菌感染(bacterial infection)| 的亞型都包括 |細菌性肺炎|

SNOMED CT 概念模型還允許在檢索資料時考慮其他細節 :
例如 : 概念 |肺炎球菌| 是 |細菌性肺炎| 的一個亞型,它具有定義關係,指定 |病原體| 是 |肺炎鏈球菌| 這使得能夠對引起這種疾病的生物體進行分析。

SNOMED-CT-Ecosystem
(圖片來源:SNOMED CT官方文件,經工研院整理製作)

SNOMED CT 表達式

SNOMED CT 表達式是一個或多個概念標識符的結構化組合,用於以邏輯方式表示臨床想法。
使用 SNOMED CT 概念的臨床表達可以有兩種類型:
1. 預先(precoordinated)協調表達,使用單一 SNOMED CT 概念標識符;
2. 後協調(postcoordinated)表達式,其中包含多個 SNOMED CT 標識符。

後協調技術的支援允許在需要時顯示額外的臨床細節。
Ex. |肺炎球菌肺炎| 有一個 |finding site| |肺結構| -> | 右上肺葉|
後協調組合方式增加了 SN​​OMED CT 可以表示的細節深度,而不必透過概念包含每種可能疾病的每個可能的特定位點。

範例:
Precoordinated representation of "Laparoscopic emergency appendectomy"
(腹腔鏡急診闌尾切除術)
Identifier of this concept : 174041007

「腹腔鏡緊急闌尾切除術」手術至少有三個不同的面向:「切除闌尾」、「使用腹腔鏡」 「緊急程序」。
SNOMED CT 概念 174041007 |腹腔鏡急診闌尾切除術|預先協調這些方面,因為其定義包括以下定義關係:
116680003 |is a| = 80146002 |闌尾切除術|
260870009 |priority| = 25876001 |緊急|
425391005 |using access device| = 86174004 |腹腔鏡|

PRE-and-POST-Expressions
(圖片來源:工研院整理製作)

以 SNOMED CT 瀏覽器搜尋概念碼

Precoordinated representation of "Laparoscopic emergency appendectomy"
(腹腔鏡急診闌尾切除術)
Identifier of this concept : 174041007

將概念碼填入SCT Browser進行搜尋:

SCT Browser
(圖片來源:SNOMED CT Browser截圖,經工研院整理製作)

以 SNOMED CT 瀏覽器搜尋詞彙 : 以心室中膈缺損為例

概念30288003(心室中膈缺損)作為前協調表達,亦可由253549006(室隔間異常)及253273004(心臟間隔缺損)兩個概念的組合。以關聯性表示,本範例概念(30288003)由兩種關聯屬性建立關係,其一為組成型態之屬性,其關聯到型態異常之概念(783804002),另一個則為發現部位之屬性,其關聯到室間隔結構之概念(589001)。

ventriculay-septal-defect-(summry)
(圖片來源:SNOMED CT Browser截圖,經工研院整理製作)

ventriculay-septal-defect-(diagram)
(圖片來源:SNOMED CT Browser截圖,經工研院整理製作)

ventriculay-septal-defect-(expression)
(圖片來源:SNOMED CT Browser截圖,經工研院整理製作)

SNOMED CT 檔案說明 : 描述及關聯表

SNOMED CT 不是軟體,其檔案被設計為關係表。文件中的每一行代表表中的一行,每個表格的第一行包含列標題, 所有其他行都包含資料。SNOMED CT 國際版以 UTF-8 編碼的製表符分隔平面檔案形式提供,可匯入任何資料庫或其他軟體應用程式。SNOMED CT國際版之檔案每個月更新一次,檔案命名以Description為例: sct2_Description_Full-en_INT_日期版本.txt。

SCT Files
(圖片來源:工研院整理製作)

sct2_Description_Full-en_INT_日期版本.txt之檔案內容格式如下表說明:

sct2 Description
(圖片來源:工研院整理製作)

摘錄Description部分檔案資料作為範例說明:

sct2 Description example
(圖片來源:工研院整理製作)

sct2_Relationship_Full-en_INT_日期版本.txt之檔案內容格式如下表說明:

sct2 Relationship
(圖片來源:工研院整理製作)

摘錄Relationship部分檔案資料作為範例說明:

sct2 Description example
(圖片來源:工研院整理製作)

SNOMED CT 關聯表之視覺化應用

SCT所提供的關聯表可以透過工具建立視覺畫圖示,用來表示疾病部位、疾病型態等之關聯,如附圖之範例。

SCT visual example
(圖片來源:工研院整理製作)

參考工具:
Cytoscape是一款網路分析的工具,以視覺化和社會網路(social network)進行分析,支持各種文件格式、數據庫的連接以及在社會網路中進行搜索。Cytoscape作為一款視覺化和社會網路分析的工具,不需要任何程式語言基礎即可操作,其能夠將不同屬性的資料合成視覺化社會網路,對於日後資料分析而言,大數據實現資料視覺化將是一大趨勢。在3.0版本之後,Cytoscape的核心開發團隊,並行了Cytoscape.js的專案,且具有Restful API,讓Cytoscape視覺化的模塊可以有更多的影響力,而不侷限在生醫領域。

SCT visual tool
(圖片來源:工研院整理製作)

SNOMED CT 課程

cover-語意標準化的重要性:SNOMED CT 編碼
語意標準化的重要性:SNOMED CT 編碼

衛生福利部資訊處 技監兼處長

李建璋

衛生服利部資訊處
  • 地址:115204 台北市南港區忠孝東路6段488號
  • 總機電話:(03) 591-9291
  • 聯絡信箱:medstandard@itri.org.tw