LOINC 使用及操作說明
LOINC 組成與內涵:
- LOINC 標準詞彙 LOINC term
- LOINC 代碼 (LOINC code)：表示的是一個實務的檢驗事件。
- Fully Specified Name (FSN)：六個軸向組合而成的檢驗事件名稱，表述模型如下，其中以冒號(:)區隔不同軸向
<Analyte/component>:<kind of property of observation or measurement>:<time aspect>:<system (sample)>: <scale>:<method>
如：禁食後的空腹血糖檢驗(單位mg/dL)，LOINC FSN 表述為Glucose^post CFst: MCnc: Pt: Ser/Plas: Qn:。 - LOINC 名稱顯示方式：
- 長名稱 (Long Common Name) 較FSN能更清楚呈現LOINC縮寫的意涵，完整呈現檢驗事件。如上述例子Fasting glucose [Mass/volume] in Serum or Plasma。
- 臨床常見的顯示名稱 (Display Name) 又再更接近臨床的使用方式較長名稱更簡潔扼的清楚呈現檢驗事件，如上述例子 Glucose post fast [Mass/Vol]。
自LOINC 2.64 版起開始發佈，目前在檢驗領域的應用多有存在其Display Name 內容，但其內容不一定符合LOINC 的唯一性。
- LOINC TERM 的六軸向結構
- 檢驗項目名稱 <Analyte/component> 結構，可分為三個部分，以” ^ ”間隔，模型表示如下 :
<[analyte]. [subclass]. [sub-subclass]> ^<[time delay] post [amount] [substance] [route])> ^<adjustment>- 主要名稱(principal name): <[analyte]. [subclass]. [sub-subclass]>
- 兩種或多種成分作為一個量進行檢測，則每種成分應在主要名稱中命名，並用加號分隔。
如：Coxsackievirus A9+B1+B2+B3+B4+B5+B6 Ab, Influenza virus A+B Ag 。 - 單獨測量多個分析物，則分析物為有空格包圍的連接號 (&) 分隔。
如：Influenza virus A & B Ag 。
- 兩種或多種成分作為一個量進行檢測，則每種成分應在主要名稱中命名，並用加號分隔。
- 臨床處置(challenge) <[time delay] post [amount] [substance] [route])>
- 時間：分/時/日/週/月等。
如：Glucose^1H post meal。 - 順序：第n套檢體。
如：Glucose^1st specimen。
- 時間：分/時/日/週/月等。
- 標準化或調整(any standardization or adjustment) ：<adjustment>
- 區分校正或調整值與未校正測量值。
如：Calcium.ionized^^adjusted to pH 7.4。
- 區分校正或調整值與未校正測量值。
- 一次觀察獲得多個結果
- 報告在同一時間和/或在同一樣本上進行的重複觀察
如：Bacteria identified^^^2
- 報告在同一時間和/或在同一樣本上進行的重複觀察
- 主要名稱(principal name): <[analyte]. [subclass]. [sub-subclass]>
- 測量單位屬性結構為主要名稱+子名稱。
如：RBCs 紅細胞成分的測量單位屬性mapping。
“per mass of hemoglobin”是質量含量(MCnt)。
“per liter of blood”是質量濃度(MCnc)。
“per red blood cell”的量是實體質量EntMass。 - 檢驗時間屬性結構如含有時間的修飾，是以“^”分隔。
如：量測8 小時心率heart rate 的最大值8H^max。 - 檢體種類<system (sample)> 結構第一部分為檢體名稱，第二部分(選擇性)表示檢體來源以“^”分隔。
如：檢體來源為病人^Patient。
- 檢驗項目名稱 <Analyte/component> 結構，可分為三個部分，以” ^ ”間隔，模型表示如下 :
- LOINC TERM 的六軸向命名規則
- 檢驗項目名稱命名規則
- 主要名稱為被檢測物質的名稱。
如：以A 型肝炎病毒為主要檢測名稱“Hepatitis A antibodies (Ab)”，非以抗體為其主要名稱“Antibodies, Hepatitis A”。 - 在提及藥物的濃度或敏感度時，是以使用藥物的通用學名，而非商品名稱。
藥物代謝常使用”nor”形式而不是”desmethyl”。
如：Propranolol (普萘洛爾)，非以商品名稱 Inderal 表述；nordoxepin，非以 desmethyldoxepin 表述。 - 在描述診斷該疾病的檢驗時，使用生物體的完整分類名稱或病毒名稱(而非疾病)。LOINC 內含細菌名稱時，是依據 <International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology > 中的完整細菌名稱；病毒名稱是依據 <Index Virum > 。如: "Orientia tsutsugamushi Ab" 非以 "Scrub typhus (恙蟲病) Ab" 表述。
- Species and groups of species: SP 標示為未知的單一物種；SPP 標示為屬(genus)之下的物種集。
如："Coffea spp Ab.IgG" 擬桿菌門的抗體IgG 檢驗，"Mycobacterium sp identified" 結核菌群的鑑定。 - 當檢測特定生物物種的抗原，但交叉反應導致其他生物體被辨識時，名稱應為檢測目標的主要生物體。
- 避免使用結合後的名詞，除非作為同義詞名稱的一部分。檢測標的物請使用其名詞。
如：血小板以“Platelet”表述，而非血栓細胞“thrombocytes”；心肌抗體以名詞 “Myocardium Ab” 而非形容詞“Myocardial Ab” 呈現。 - 維生素以其化學名稱而非編號。
如：維生素“thiamine”而非 Vitamin B1，但營養學領域會使用廣為接受的名稱。 - 血清學檢測需釐清是測量抗原(Ag)還是抗體(Ab)，並避免多餘的ANTI-X。
如：“anti-smooth muscle Ab” 應表示為“Smooth muscle Ab” (平滑肌抗體)。 - 梅毒快速病毒性抗體測試(VDRL)請以Reagin Ab 為其標準名稱。
- 使用化學名稱表示陰離子(anion)，而不是酸類(acid)的名稱。醇類請使用單一字詞名稱。希臘字母請以英文名稱表示。
- 避免使用total 在檢驗項目名稱裡，除非其表示分數的分母。時間單位的縮寫，例如Y 代表年，D 代表日，W 代表週。這僅適用於作為測量單位的時間。
- 分析物名稱中的標點符號避免使用特殊字符，例如逗號、破折號和括號。
- 所有名稱均不區分大小寫。但從 2019 年 6 月開始，LOINC 版本 2.66 開始，根據Institute for Safe Medication Practices 推薦的列表對名稱相似的藥物採用大寫字母以辨識。
如：“Lua”以L little u super little a Ab”呈現。 - 數字應以阿拉伯語形式表示。除非像Coagulation factor VIII 抗凝血因子這類傳統以使用羅馬數字表示。
- 使用” exp ”來表示Component 中的指數。
如：指數的2.7 次方表示如Myocardial mass/Height exp 2.7。 - 檢驗項目名稱常見全名。
如：名稱以全名表示而非縮寫，如"total", "fraction", "oxygen", "Alpha", and "Beta"。 - 檢驗項目名稱常見縮寫
Ab: Antibody。
Ag: Antigen。
DNA: Deoxyribonucleic acid。
HIV: Human immunodeficiency virus。
HLA: Human histocompatibility complex derived antigens。
HTLV I: Human t-cell lymphotropic virus-I。
Ig “X”: Immunoglobulins (e.g., IgG for immunoglobulin G, IgM for immunoglobulin M)。
NOS: Not otherwise specified。
RNA: Ribonucleic acid。
rRNA: Ribosomal ribonucleic acid。
- 主要名稱為被檢測物質的名稱。
- 測量單位屬性結構為主要名稱+子名稱，依特性區分定量與定性，命名規則說明如下:
- 定量特性：同一物質相關的不同類型的量:
- 主要名稱：質量Mass、物質Substance、催化活性Catalytic activity、數字Number、任意Arbitrary。
- 子名稱：濃度Concentrations、含量Contents、比率Ratios、分數、Fractions、速率Rates。
如：常見的組合為任意濃度ACnc。
主要名稱如固定以質量Mass ，常見的子名稱組合:
Mass Concentration (MCnc)
Mass Content (MCnt)
Mass ratio (Mrto)
Mass fraction (MFr)
Mass rate (MRat)
- 定性特性：
- 存在或閾值 (Presence or Threshold, PrThr)。
- 存在或辨識 (Presence or identity, Prid)。
- 類型 (Type)：存在已知的情況下識別特定分析物的測定。
如：已知含有肺炎鏈球菌的分離株以確定特定血清型，則鑑別的血清型別測量單位屬性為Type。 - Seq (核苷酸序列) 和Loc (位置)。
- 定量特性：同一物質相關的不同類型的量:
- 檢驗時間屬性 <kind of property> 命名規則:
- point or moment in time: 特定一個時點或時刻進行測量。
- time interval: 在指定時間間隔內測量的某些“平均”屬性。
- 最常見的是24H (採集時間可能為 23 小時，但仍稱為 24 小時研究)。
- Stdy 研究期間（未指定具體時間）。
- Enctr 到院期間（急診室就診、住院等）。
- 常見的時間修飾縮寫:
min : Minimum value over interval
max : Maximum value over interval
frst : First value observed during an interval
last : Last value observed during an interval
mean : Mean of all of the values observed on the interval (This is the default selection.)
- 檢體種類 <system (sample)> 命名規則:
- 檢體名稱
- 生化檢驗的檢體通常為血清、尿液、血液和腦脊髓液；而微生物培養之檢體則來自於多樣的來源。
- Body fld 的設計主要是表示血清、血漿、血液、尿液和腦脊髓液以外的體液（生物液體）。但如明確知道檢體名稱如胸肋膜液、腹膜液、關節液和其他類型的液體，應盡可能對應存在的LOINC TERM。
- XXX 的設計主要是用於辨識未知或未指定的物質，可以是固體或液體；可以是生物或非生物的物質。
- 當血清或血漿檢測在臨床上等效時，檢體應記錄為Ser/Plas，意思是“血清或血漿”。
- 如果對樣本組合進行檢驗（如腦脊液和血漿中發現的物質的比例），則樣本類型用“+”連接，例如：Plas+CSF、Ser+CSF 或Isolate+Ser。
- 檢體來源
- 預設為病人 (^Patient)。
- 可用於指示之檢體來源別。
如：血液製品單位(血品/BPU)、骨膸損贈者、新生兒。
- 檢體名稱
- 檢驗單位屬性命名規則:
- 定量(Qn)：檢驗結果為連續數值或數值範圍。以整數、比率、實數或範圍的形式報告。測試結果值可以選擇包含來自集合 {<=, <, >, >=} 的關係運算符。
“7”、“-7”、“0.125”、“<10.15”、“>12000” , 1-10, 1:256。 - 順序(Ord)：檢驗結果為具順序性的分類，如是否；1+、2+、3+；正負；有反應的、不確定的、不具反應的。
- 數量或順序(OrdQn)：檢驗結果可以為Ord 或Qn，如微生物的敏感性試驗(或Agar diffusion、MIC 等)可以報告為耐藥、中度、敏感或抑菌圈的直徑。
- 名義(Nom)：檢驗結果沒有順序性的名稱，如細菌名稱、編碼，或沒有自然排序的外觀類別，如黃色、透明、鮮紅色。
- 敘述(Nar)：報告為文字敘述，多用於clinical LOINC。
- 文檔(Doc)：報告格式(XML,HTML, PDF, JPG, 敘述性文字等)的文檔。
- 定量(Qn)：檢驗結果為連續數值或數值範圍。以整數、比率、實數或範圍的形式報告。測試結果值可以選擇包含來自集合 {<=, <, >, >=} 的關係運算符。
- 檢驗方法命名規則:
- 檢驗方法在生化和血液學檢驗，常因臨床緊急程度、工具的交換、調整儀器可產生相同結果等，因此檢驗方法的精細程度會以較廣義的方式去定義。
- 檢驗方法在免疫學/血清學檢驗，因測試的敏感性和特異性隨方法的不同而變化幅度很大，因此在微生物檢驗或凝血測試等會描述檢驗方法。
- 免疫分析:
- 檢測抗原和抗體連接的免疫分析法，例如EIA、ELISA、化學螢光和其他類似的測試。
- Immune blot (IB) 、immune diffusion 和免疫的流式細胞術 ( immune based flow cytometry (FC) ) 測試，因它們通常會產生多個相關的觀察結果，因此具有特定的檢驗方法名稱。
- 免疫熒光測試（IFA、DFA 和 ACIF）也有自己的檢驗方法類型，即Immune fluorescence (IF)，因為它們可提供有關目標分析物的存在或數量及其在塗片、組織切片或細胞上的位置（或模式）的信息。
- 核酸鑑定方法:
- Probe 不包括核酸擴增或信號增強步驟的測定。
- Probe.amp.sig 短核酸片段與目標靶標特異的互補核酸序列結合，然後進行信號增強步驟，當探針與目標序列結合時產生的信號倍增，使其更容易檢測。
- Probe.amp.tar 核酸擴增步驟的測定如聚合酶鏈反應(PCR)，其目標核酸使用雜交探針。
- Non-probe.amp.tar 核酸擴增，其目標核酸使用雜交探針以外的方法，例如熔解曲線分析或濁度測量。
- 分子遺傳學分析法:Molgen (Molecular genetics) 用以含括表示限制性片段長度多型性分析 (Restriction Fragment Length Polymorphysim, RFLP)、聚合酶鏈反應 (Polymerase chain reaction, PCR) 、以及基因定序(sequencing) 等檢測基因屬性的方法。
- 檢測上限：主要用於甲狀腺促進素和尿白蛋白，依廠商所需以區分檢測閾值至少有一個數值 (10 倍) 差異的測試，檢驗方法因應廠商開發所需，而有設定檢測上限，檢驗醫學領域認為此訊息相對使用何種檢驗方法來得重要。
- 檢驗項目名稱命名規則
